COVID-19 Omicron Dilaporkan Punya Saudara, BA.2 yang Sulit Terlacak Tes PCR

Liputan6.com, Oxford - Para ilmuwan telah menemukan garis keturunan 'saudara' dari varian Omicron COVID-19, yang dijuluki BA.2, yang telah terdeteksi tujuh kali di Afrika Selatan, Australia, dan Kanada.

Jenis baru Omicron berbeda dalam banyak hal dari jenis pertama (BA.1), dengan para ilmuwan mengatakan BA.2 jauh lebih sulit dideteksi melalui tes PCR konvensional, demikian seperti dikutip dari Mashable, Sabtu (11/12/2021).

Meskipun membawa banyak mutasi yang sama dengan BA.1, garis keturunan baru tidak memiliki mutasi gen S yang vital, yang membuat jenis pertama mudah dideteksi dalam tes PCR standar - juga metode yang paling umum digunakan untuk mencari varian Omicron pada infeksi baru.

Sementara BA.2 tentu saja lebih sulit dilacak, para ilmuwan mengatakan tidak ada alasan untuk mengkhawatirkannya karena bukan tidak mungkin untuk dideteksi. Hanya saja, proses untuk melacaknya akan lebih memakan waktu dan sulit ketimbang COVID-19 varian sebelumnya.

"Saya tidak berpikir ada alasan untuk berpikir bahwa jenis baru lebih merupakan ancaman daripada bentuk Omicron yang saat ini ada di Inggris," kata David Stuart, seorang profesor biologi struktural di Universitas Oxford. "Tapi ini sangat awal."

BA.2 masih harus dideteksi dalam tes PCR standar. Tantangannya adalah dalam membedakannya dari BA.1 ketika menganalisis hasil tes.

Namun, BA.2 juga memiliki beberapa mutasi yang tidak ada di BA.1, dan sebaliknya. Tidak adanya mutasi 69/70del pada gen S adalah apa yang membuatnya lebih sulit untuk dideteksi.

Untuk memahami semua ini, pertama-tama kita harus memahami bagaimana tes PCR mendeteksi Omicron BA.1.

Ketika seseorang yang terinfeksi Omicron BA.1 diuji, tes PCR mencari penanda yang berbeda untuk melihat apakah orang tersebut membawa COVID-19, termasuk gen S.

Pada seseorang yang terinfeksi BA.1, penanda gen S tidak akan bekerja (atau menunjukkan nilai apa pun).

Dengan kata lain, kurangnya hasil ini disebut 'putus gen S', dan itulah yang menandai pasien Omicron BA.1, memisahkan mereka dari varian lain dari COVID-19.

Tetapi karena BA.2 tidak memiliki mutasi gen S, para ilmuwan harus bergantung pada sekuensing genom, yang membutuhkan lebih banyak waktu dan usaha.

Berbicara kepada Financial Times, ahli genetika evolusi Universitas Basel Emma Hodcroft mengatakan bahwa mungkin ada lebih banyak jenis Omicron daripada yang saat ini disadari para ilmuwan, yang dapat membuat pelacakan global jauh lebih sulit.

"Dari angka yang kita miliki saat ini, saya tidak berpikir ada beban tersembunyi yang sangat besar dari BA.2," katanya.

Meskipun ada kesulitan tambahan, Hodcroft mengatakan tes PCR masih berfungsi sebagaimana mestinya. Tidak ada 'jalan pintas' (putus gen S) untuk mendeteksi BA.2.